故事发生在人类和魔物共存的城市林德·沃尔姆，格伦（土岐隼一 配音）是活跃在此的一名新人医生。对于自己的事业，格伦有着崇高的追求，虽然年纪轻轻的他并没有什么丰富的医疗经验，但他总是用自己的一片真心去对待手下的患者，无论这些患者有多么的“奇形怪状”。                                    
                               　　在行医的过程中，格伦结交了许多好友——深深爱慕着格伦的半人马千金大小姐缇萨莉亚（布里德卡特·塞拉·惠美 配音）、拥有动人歌声爱财如命的人鱼姬露菈菈（藤井雪代 配音）、成熟美丽却举止怪异的服装设计师阿拉涅（嶋村侑 配音）和拥有巨大的权利和极小的声音的龙女斯卡蒂（种﨑敦美 配音）。

　　所谓 PET 称的是有着改变他人记忆的超能力少年，他们被黑社会管理操控来替黑社会达成不可告人的目的，而这群「PET」的领袖为了拯救自己的同伴居然从黑社会手里逃走了。 人类的记忆很多但是高兴的记忆堆在山上，不愉快的记忆则是放在谷底，而正是在这山谷起伏之间一个人才能够得以存在。 能够修改他人记忆的「PET」们自身凭借自己的记忆建立起的超越家人的信赖关系，很多时候记忆是会骗人的甚至是自欺欺人，我们自己也会不经意间修正不喜欢的记忆，至少让自己觉得这些记忆好看一些。

　　甜梦猫是浅紫罗兰色的小猫玩偶，由住在天上的世界、身为布偶工匠的妖精们所制造。一天，甜梦猫从天上掉下来，被一个人类女孩拾起并带回家。女孩每天都抱起甜梦猫，与她说话；甜梦猫为了表达她的谢意，向月亮许愿，然后她的耳朵里的星星斑纹被月光照亮，发出光芒，就变得能够说话了。女孩与甜梦猫于是每天都一起谈话，而且晚上一起睡觉会发一样的梦，在梦中一起玩耍、一起聊小秘密......

　　天上欧蒂娜（川上伦子 配音）从小就失去了父母，某日，她遇见了一位英俊的王子，王子交给了欧蒂娜一枚戒指，告诉她这枚戒指或许能够使他们在遥远的未来再次相遇。王子英俊的身姿和温柔的话语在欧蒂娜的内心留下了深刻的印象，她希望自己最终也能如此优雅。
　　在戒指的指引下，欧蒂娜进入了凤学园就读，在这里，流行着名为一个王子游戏，在决斗中获胜的一方可以得到“蔷薇新娘”姬宫安茜（渊崎有里子 配音），成为她的支配者。西园寺荚一（草尾毅 饰）是安茜目前的主人，然而，欧蒂娜最终将他打败，得到了安茜，随着时间的推移，欧蒂娜和安茜之间产生了深厚的情义。

在新的动荡的预感前，有一个短暂的幕间故事—— 古城和雪菜在围绕圣歼的与沃特勒的战斗中获胜。 古城堡因为弓神岛被划分为自己的“夜晚帝国”而成为了岛上的实际统治者。 我过着和以前没什么变化的日常生活。 就在这个时候，关于弓神岛周边海域发生的原因不明的海难事故， 狮子王机关和太史局将进行联合调查。 另一方面，古城被呼唤自己的声音吵醒了。 在他记忆模糊的视野里， 雪菜红着脸，好像是睡在自己的包里。 “前辈……我把重要的东西弄丢了……”

　　近未来的日本，一个叫做“疏濑”的城市中，市民过着平凡的生活，只不过，在城市的一角，山冈上面耸立着医疗机器制造厂建造的外形酷似熨斗的工厂，每天固定时刻，那个工厂都像刚烫完东西一样散发出大量蒸汽。
　　小学6年级学生直太，与高中女生真见美，直太那个留学的哥哥的女友，一起在河边打发时间。本该是继续平凡的日子，随着传说中的蜜蜂女——睛子驾驶的电车撞上直太而结束了。直太头上长出了奇怪的角！而睛子居然成为直太家的佣人进入了直太家。睛子的秘密与她口中常念起的“FLCL”的含义，令直太的生活有了翻天覆地的改变。

　　花园花铃（中原麻衣 配音）拥有着悲惨的身世，在她尚且没有记忆的时候，父母就过世了。之后，叔母收留了无处可去的花铃。花铃虽然个性善良而又温柔，脑袋却有些笨笨的，无论是成绩也好运动也好人际交往也好，她都慢别人一步，因此常常遭到叔母的责骂。花铃唯一的好朋友是她的宠物猫小西，然而有一天，小西也离她而去。
　　一次偶然中，花铃发现了母亲留下来的一枚戒指，这枚戒指拥有神奇的法力，能够让花铃变身成为魔法少女。之后，花铃又遇见了九条姬香（下屋则子 配音）和九条和音（泽城美雪 配音），他们也拥有着各自的戒指。

　　雪男は燐に決別を告げ、イルミナティへと向かってしまった。
　　強さを求め、真実を求める雪男と向き合うためには、
　　自分たちの出生の秘密を知る必要があると決意した燐は、
　　メフィストの手引きで過去へと旅立つ。
　　燐は、育ての父である藤本獅郎と実の母である
　　ユリ・エギンの足跡を辿っていくが、
　　二人が生きた道筋は、想像を超える過酷なものだった――
　　なぜ、悪魔の神であるサタンと
　　人との間に仔が生まれたのか。
　　〝青い夜〟とは何だったのか。
　　すべてを知ったとき、燐が出す答えとは……。
　　物語はいよいよ「青の祓魔師」の核心を暴き出す――

千年以前，死神费亚罗廉在天界犯下大错而逃到人间。后来人心因为受到邪恶死神的控制，而陷入一片恐慌。天界长者为人间悲状感到哀伤，为了惩戒邪恶的费亚罗廉，据说天界降下七道光芒。他们被成为七鬼神，据说在巴尔斯布鲁克教会所在之地对邪恶的费亚罗廉进行封印。                                    
                               　　有一个戴着誓言颈环的男子出现在泰德的梦中，而这个梦反复出现在他的梦中，使泰德困惑不已。此时的他和好友米卡杰已经成为了巴尔斯布鲁克帝国陆军士官学校的优秀学生。他们为了能进入梦想已久的霍普鲁克要塞而向毕业考试发起了挑战。对于毕业后的生活充满了期待，但当泰德见到了率领着战斗部队的阿亚纳米参谋长时，他的记忆恢复，想起了自己是拉古斯王国国王的儿子的事。泰德在冲动下攻击帝国军的长官阿亚纳米，不幸被抓住并被送往监狱，之后在好朋友米卡杰的帮助下驾驶飞行器逃狱，但被阿亚纳米击中，坠落至第七区的巴尔斯布鲁克教会。

　　莉丝妲黛（丰崎爱生 配音）是刚刚上任没多久的新手女神，可这样的她要面临的，是难度为S级别的拯救世界的任务。为此，莉丝妲黛召唤出了名为龙宫院圣哉（梅原裕一郎 配音）的勇者，让莉丝妲黛松了一口气的是，圣哉丛数值上来看属于那种超强的勇者，可很快，他就暴露了他唯一，但也是致命的弱点——过于慎重的个性。
　　必须同时准备至少三套装备以备不时之需；把自己关在房间里练肌肉练到满级也不愿意出来；即便对手是史莱姆也要使出全力攻击，渐渐地，莉丝妲黛开始怀疑，这个看上去很靠谱的男人，是不是头脑有点问题？

日本的某处、被美丽的大自然所包围的山间小镇。在这样的镇上，设立着一所自然而亲切的巨大绚烂豪华学校，私立乙桥学校。通过学园中平凡的少女来栖川姬子为中心，故事开始了。作为名门的大小姐，文武双全、才色兼备，没有恶习的性格、作为学院的偶像的姬宫千歌音，还有姬子的青梅竹马，有点没用但却很诚实的大神相马。姬子被两位伙伴包围着，明亮而快乐的学员生活。姬子16岁的生日来临了，三人的命运也开始了变化