赛菲罗斯的事件已经过去2年了，人类从巨大陨石的灾难之下逃脱。曾经繁荣的都市虽然满目疮痍，但人们已经开始投入重建家园的工作之中。而拯救世界的英雄克劳德，却过着与世隔绝的生活。
　　但是，神秘的疾病“星痕症候群”在世界蔓延。蒂法•洛克哈特决定找寻克劳德。但当她找到克劳德之时，眼前这个人，只是一个为艾利斯之死郁郁寡欢的落魄男子。
　　以继承赛菲罗斯的遗志而组成的白发三人组出现在人们眼前，文森特不得不再次挥动双枪，保护大家。而世界的英雄，克劳德，能否再次振作，守护这个世界呢？

　　在一场人类的浩劫之中，兰顿（三瓶由布子 配音）的父亲牺牲了自己，拯救了地球，被称为英雄永久的记入了史册。失去父亲后，兰顿一直和身为机械工程师的祖父相依为命。日复一日的寻常生活让兰顿感到十分压抑，只有一件事情能够激起他的兴趣，那就是在青年之中十分流行的“滑空”运动。兰顿十分仰慕滑空天才霍兰德（藤原启治 配音），一直希望能够加入他的组织“月光洲”。
　　某日，一位名叫优莱卡（名冢佳织 配音）的神秘女孩驾驶着一架故障的LOF从天而降落到了兰顿的家中，随后，军队赶到，似乎在对优莱卡进行追捕。兰顿凭借着自己的勇气和实力战胜了军队，并因此而获得了加入月光洲的机会，少年平凡的命运就此改变。

　　《圣魔之血》原著名《Trinity Blood》，是日本作家吉田直在《The Sneaker》杂志连载之巴洛克风奇幻小说，内容环绕在“大灾难”造成文明毁灭的遥远未来。
　　故事的舞台在未来的欧洲大陆。混乱的世界，神和魔鬼是世界的两个极端，他们相距人类很近，两者却有着天差地别的能力。圣堂的新神父亚伯·奈特罗德（Able Nightrord），看似一幅迷糊的表情，却有着不为人知的一面。只因他是身在神殿却流着恶魔之血的异种新人——吸食吸血鬼之血的吸血鬼。一方面他的存在受人类排挤，另一方面圣殿的人为了对抗遍布世界的各种恐怖生物又要借助他的力量。在和名为艾丝缇·布兰雪（Esther Blanchett）的少女相遇之后，两个人的命运都发生了极大的改变。在这种无法理清的矛盾中故事拉开了序幕……

本作的主人公是一位名叫津崎青叶的女孩，她明亮开朗，富有朝气。某天，津崎青叶突然被神秘人士绑架，并被带到南美洲委内瑞拉一个叫做“天使”的组织里。在那里在，津崎青叶被迫成为了叫做“人机”的巨型机器人兵器的驾驶员。而青叶的好朋友黄坂露伊，也作为莫利比特2号操纵者被一起卷进了战斗中。                                                                      　　三年之后，世界各地都出现了瞬间将整个城市毁灭的可怕事件，实际上，这是一个名为基姆的组织使用“人机”对世界各地进行攻击所造成的。为此，“天使”展开了对该组织的追击。另一方面，在日本东京，失去了三年前全部记忆的女孩赤绪为了保卫朋友们，加入了“天使”，同基姆展开了战斗……                                                                      　　【STAFF】                                                                      　　監督 ：　むらた雅彦                                                                      　　シリーズ構成 ：　荒川稔久                                                                      　　キャラクターデザイン ：　細田直人                                                                      　　メカデザイン ：　田村勝之                                                                      　　美術監督 ：　小坂部直子                                                                      　　音楽 ：　川井憲次                                                                      　　音響監督 ：　若林和弘                                                                      　　アニメーション制作 ：　フィール

在公元已经足以纪年的未来，一个称作“R.U.C.”的巨大企业创造了巨大的高现代化都市，而人类就在其中创造着新的历史。                                                                      　　秘密被制造出来的“索尔提”是世界上唯一的全部由机械制造的人形生命，同时她也拥有着自我的意识。不久，索尔提逃出了出生的地方，为了躲避来自秘密势力的追捕而在城市里逃亡。失去了记忆，也不知道该去何方的她，在城市里陆续结识了善良的人们，开始象一个凿凿有据孩子那样成长……