四谷友助（上村祐翔 配音）是一名中学三年级的男生，在班上友助属于默默无闻的那类学生，他既不喜欢结交朋友，在课业上也平平无奇，总是独来独往。一天放学后，友助在意外中穿越到了异世界，让友助震惊的是，他在这里竟然遇见了同班同学新堂衣宇（久保田梨沙 配音）和箱崎红末（和气杏未 配音），她们一个是班级里人气极高的美少女，另一个则体弱多病，总是在病假中。然而，在这个世界里，他们三人是并肩作战的伙伴。
　　这并不是一个和平的世界，友助一行人要对抗的，是比他们强大的多的敌人，为了获得胜利保住性命，一切都有被利用的价值，甚至是同伴们的生命，亦可拿来作为与对手博弈的棋子。

　　二海堂昶（小野大辅 配音）是个性格孤僻不爱上学的不良少年，在一次逃学的路上，昶遇见了一位行事神秘的黑衣男子。男子名叫白银（诹访部顺一 配音），他告诉昶，自己和昶有着不可分割的羁绊，并和昶约定晚上十时在校舍见面。昶并不将此当做一回事，但令他没有想到的是，通过这次见面，一个光与影的新世界展开在了昶的面前。
　　在校舍，昶遭到了神秘怪物的袭击，虽被白银所救，但昶却永远的失去了自己的影子。为了保持自己的存在感，昶与白银签订了契约，白银成为了昶暂时的影子。之后，被成为“黑魑”的怪物不断的骚扰着两人，而昶也被卷入了一场影子的争夺战之中。

现在都市犯罪日益猖蹶时，一个神秘人物崭露头角。他不是警察，也有别于一般私人侦探和保镖，而是位我行我素的侠探，他复姓冴羽，单名獠，人称"城市猎人 "。他身怀绝技，足智多谋，见义勇为而又性情诙谐，即使在难中也要开些超级玩笑：偏偏还能屡屡得到佳人相助，从而演出一幕幕情义交织的精彩活剧……

　　2031年，由于作为次世代能量装置而开发的“量子反应堆”的暴走事故，世界剧变。突然从地下蔓延的闪光，吞噬都市楼群、覆盖大地，最终，超越、融合了生物、机械、植物的未知特异进化生物“B.R.A.I”出现了。
　　7年后，翔龙重生为绝对防卫都市“新翔龙”。它以惊人的速度完成进化，并成为与陷人类于灭亡危机的B.R.A.I相对抗的人类最后的希望要塞。
　　被命运所引导而集合在新翔龙的雷昂、可依、坤灵、道格。将他们迎入防卫军的塞西尔、凯恩、杰、格伦。于是，赌上人类存亡而战的特殊部队“潘多拉”诞生了。
　　契约之时，希望被托付给了他们——

西历5012年。突然入侵地球的＜外星人＞与其制造的＜机械生物＞导致人类面临灭亡危机。                                                                      　　仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用＜人造人＞士兵展开反攻作战。                                                                      　　然而无限增加的＜机械生物＞阻挡在前，战争陷入胶著状态。                                                                      　　作为最终兵器，人类派遣新型人造人＜寄叶＞部队至地球。刚被派往地球的＜2B＞与先行调查员＜9S＞会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……。                                                                      　　这是关于为人类而战，无生命＜人造人＞的故事－－                                                                      　　PS：Automata指的是“自动人形”，别再机械纪元求求了。

　　位于叶佩特斯半岛，以700年历史而自豪的大国——奥尔坦西亚王国。
　　王国的丰穰土地受到周边国的觊觎，数次暴露在侵略的威胁之下，但侍奉王国的两大公国——奥利维亚公国和科美利亚公国化作王国的剑和盾，使得王国在漫长的岁月中免于战祸。
　　然而，圣王历767年12月5日，科美利亚公国突然对奥尔坦西亚王国掀起反旗。
　　科美利亚公国的反叛，以及在叛乱的同时现身的魔物，使得奥尔坦西亚王国迎来了混乱时代……
　　在战乱的世间，陷身于多舛命运之中的骑士们。
　　由悲剧开始，宿命的继承与战斗，就此启动。

　　由于联合军的阴谋，先帝戈萨十五世陛下驾崩，年少继位的阿萨琳十六世在大臣的极力推动下，发动了对联合宇宙军的全面战争。与此同时，联合宇宙军也在全力备战，招募士兵。在诱人的美女征兵广告前，杰斯迪·植木·泰勒动心了，于是他来到征兵处，面对入伍动机询问，他给出了以下经典回答：军队这种地方，吃饭不要钱，制服和生活日常用品全部都……不要钱！又不用担心房租，要取得各种执照也轻易，再加上搭乘宇宙战舰的话，到达敌方以前整天可以在冷气密封仓里睡觉，同时可以坐着做工作，没有比这更轻松的行业啦！不是吗？同时呀阁下！退役后又有退休年金可以过悠闲的生活，这实在令人向往呀！如此回答，基本上没人会让这种人加入军队的，然后，泰勒的演讲开始了！