《黑子的篮球》故事主要围绕两位主人公——被誉为第六位“奇迹世代”的黑子哲也以及从美国归来的天才篮球选手火神大我展开，两人在球场上市光与影的搭档。相遇后的他们将挑战其他五位“奇迹世代”。

　　告别了多灾多难的初中时代，升入高中的宇佐和成（井口佑一 配音）下定决心度过平稳安和的三年，并与一名清纯温柔的少女共享难得的青春时代。在学校图书馆，宇佐偶然邂逅专心读书的前辈河合律（花泽香菜 配音），不禁心思荡漾。恰逢此时，宇佐的父母调动工作，为了能够自由生活，他计划入由河合住子（小林沙苗 配音）担任管理员的河合庄，结果却遭遇了小学时代的变态同学城崎（四宫豪 配音）、男人缘超级差的锦野麻弓（佐藤利奈 配音）和调皮腹黑女渡辺彩花（金元寿子 配音）。原打算从怪人世界逃脱，当得知小律也在此居住时，他却身不由己地留了下来。充满未知的青春时代，笑与泪共存的故事就此上演……
　　本片根据宫原琉璃的漫画改编。

　　沉淀了历史浓厚气息的京都伏见，生活着一个有些鲁莽但十分单纯的女孩伏见稻荷（大空直美 配音）。她从小在供奉着狐仙的稻禾神社玩耍，对这里有着深深的羁绊。稻荷偷偷喜欢同班的帅气男孩丹波桥红司（冈本宽志 配音），无奈对方似乎只对美丽的墨染朱美（野水伊织 配音）感兴趣。因意外惹恼丹波桥的稻荷闷闷不乐，此前她偶然救助过一只小狐狸，因此得以觐见神社的狐仙宇迦之御魂神（桑岛法子 配音）。
　　在神的帮助下，稻荷拥有了变身的能力，可以自由变化成任何实际存在的人。加上小狐狸空从旁相助，女孩的青春发生了变化……

　　在人鱼的世界中有着这样的规定，如果不巧被某人类看到了真身，那么，除了和其结婚或将其杀死，没有第三种选择。普通的少年满潮永澄（水岛大宙 配音）在一次溺水中被人鱼濑户灿（桃井春子 配音）所救，按照规定，灿成为了永澄的妻子。没想到，灿居然是濑户海黑社会老大的女儿，个性有些懦弱的永澄将面对怎样悲惨的命运呢？
　　同时，随着永澄和灿的婚期的推进，越来越多的人鱼聚集到了永澄的身边。双重人格的江户前留奈（野川樱 配音），一心想要至永澄于死地的卷（桑谷夏子 配音），精明强干的剑士不知火明乃（喜多村英梨 配音），这些可爱的人鱼们除了给永澄的生活增添了不少麻烦外，也带来了很多的快乐。

　　虽然说青春期的男孩子对女孩子感兴趣是极为正常和健康的事情，但少年横寺阳人（梶裕贵 配音）显然已经超出了正常的范围，在他的脑子里，除了妹子外别无他物，就连加入田径社这么热血的事情，也只是因为可以看见游泳社的女孩子们穿泳装。田径社社长似乎想把自己的位子传给阳人，而阳人温吞的性格导致他根本无法拒绝。
　　当好友告诉阳人向不笑猫像许愿可以解决烦恼的时候，阳人仿佛看到了新的希望。在前往许愿的途中，阳人遇到了少女筒隐月子（小仓唯 配音），她也是赶来向不笑猫像许愿的。就这样，阳人和月子的愿望实现了，前者丢掉了“表面功夫”而后者再也说不出“真心话”了。实现愿望后的生活并不如想象般的美好，在吃尽了苦头之后，阳人和月子决定联合起来，誓要取回他们失去的东西。

　　寒冷的北海道钏路，可爱的高一新生高桥七美（ささきのぞみ 配音）刚刚入学便结实了英俊帅气被全校绝大多数女生喜欢的矢野元晴（矢崎广 配音）。从最初的心存反感到后来的神思牵挂，七美对元晴的情感也悄悄发生着变化。可是，元晴似乎藏着难以为人道的孤独和忧伤。原来他曾有一个相互爱恋的女友山本奈奈（ゆりん 配音），但是一场事故夺去恋人的生命。终于有一天，七美鼓起勇气向元晴表白，元晴也向这个单纯执著的女孩打开心门。从这一天起，这对恋人以及他们身边所有的好友开始经历着一段交织着苦乐辛酸的青春爱情之旅……
　　本片根据小畑友纪2004年荣获第50回小学馆漫画赏少女部门嘉奖的少女纯爱漫画《我们的存在》改编。

　　表面上，琴浦春香（金元寿子 配音）是一个外表可爱的普通少女，但只有她自己知道，自己所拥有的，能够读懂他人内心的超能令是多么的让她感到困扰。从小到大，因为这超能力，琴浦不知道受到了多少的伤害，而封闭心门，似乎成为了减少痛苦的唯一方式。
　　就这样，琴浦升上了高中，本以为压抑的生活还将继续，没想到，一群好友的出现彻底改变了她的生活。外表吊儿郎当但内心十分纯情的真锅义久（福岛润 配音），一心想证明超能力确实存在的御舟百合子（花泽香菜 配音），傲娇又天真的森谷日和（久保由利香 配音），在这些朋友的陪伴下，琴浦体会到了一种正面的能量，而她和真锅之间的感情也发生了微妙的变化。

　　对于班级里的同学来说，橘梅（茅野爱衣 配音）是个怪人，个性阴沉不说，独来独往的作风也让人无法忍受。而对于橘梅来说，曾经被背叛的经历让她对每一个接近自己身边的人充满着防御和戒备。这样的高中生活，可能就要在嘲笑和欺负中惨淡度过了。一次意外中，橘梅居然踢伤了在学校有超高人气的帅哥黑泽大和（樱井孝宏 配音），令本以为要挨揍的橘梅意外的是，黑泽居然笑着提出了成为朋友的请求。
　　曾经也有过自闭历程的黑泽十分能够理解橘梅的处境，在和橘梅的相处中，他渐渐的对这个外冷内热的女孩产生了好感。同样的，在与黑泽的交往中，橘梅逐渐的领悟到了朋友和爱的重要性。

　　为了纪念着一去不复返的夏天，喜爱摄影的少年雾岛海人（岛崎信长 配音）决定和朋友们自导自演一部影片。正当影片准备动工之时，陌生女孩贵月一花（户松遥 配音）的身影吸引了海人的视线。海人被一花的外表和性格深深的吸引着，而这位行为举止有些怪异的转学生似乎隐藏着什么不可告人的秘密。
　　长相幼稚身材却姣好的谷川柑菜（石原夏织 配音），成熟稳重的石垣哲朗（荻原秀树 配音），性格胆小容易害羞的北原美樱（阿澄佳奈 配音），个性诡异不可琢磨的山乃柠檬（田村由加莉 配音），无论结局怎样，在这样的盛夏，和朋友们在一起度过的每一天，都将成为海人无法忘却的珍贵记忆。

故事的地点发生在这个整年都会不可思议地开着樱花而出名的新月型岛--初音岛。                                                                      　　梦幻的初音岛上发生了不可思议的现象，本不会枯萎的樱花在一夜之间突然枯萎了。两年之后，樱花再度在初音岛上绽放。主人公朝仓纯一进入风见学园，继续过着校园生活。他的口头禅“好困”消失了，变成了勤勉努力，热衷体育的开朗青年。此时，他的两个妹妹，两年前离去的朝仓音梦..

　　单纯善良的北白川玉子（洲崎绫 配音）、外刚内柔的常盘绿（金子有希 配音）、我行我素的牧野神奈（长妻树里 配音）和外冷内热的朝雾史织（山下百合惠 配音），四位好友相互陪伴，度过了人生中最快乐的三个年头，如今，毕业季在即，面对尚且处于迷雾之中的未来，四个女孩心中有着隐隐的不安，但更多的，还是对日后生活的希冀和幻想。
　　玉子家中世代经营着一间打糕店，而玉子又是家中的长女，这让玉子不得不开始考虑起了继承家业的想法。与此同时，玉子的青梅竹马大路饼藏（田丸笃志 配音）亦有着自己的选择，尽管他家和玉子家是商店街的竞争对手，但他俨然已经喜欢上了可爱的玉子。

　　原本相看两生厌、互不信任不会武功的文治皇帝和舞刀弄枪的武将皇后因意外互换了身体，不得不接受现实的两人，在扮演对方身份的过程中，解开了误会，学会了爱与信任。结发为夫妻，恩爱两不疑。